Da universidade de zagreb é o mais velho, não só no território da Croácia, mas e no Sudeste da Europa. A data de sua fundação oficial é considerado de 23 de setembro de 1669 ano, quando o imperador romano e hungarian-croata, o rei Leopoldo I da emitiu uma lei que reconhece os privilégios e status de universidade, instituição de ensino de ex-jesuíta academia, que funcionava no local de cidade real livre de Zagreb, antiga capital do Reino da Croácia e Eslavônia. Esta data é o início da história Загребского da universidade na sua luta pela implementação de vida recebidos direitos e mais digno de um lugar entre as respeitáveis e representativas, universidades e academias da Europa Central.

A história Загребского da universidade moderna, a sua forma começa com a iniciativa джяковского do bispo e de respeito croata patrono Йосипа Юрая Штроссмайера, quando ele em 1861 propôs a organizar-se em uma universidade de quatro faculdades: medicina, теологический, filosófico e jurídico. Esta oferta foi visto por vários anos, e em 1874, o croata, o parlamento aprovou esta iniciativa e emitiu uma resolução "Sobre a universidade". No mesmo ano, a universidade mudou de nome e começou a ser chamado de Moderno universidade de Zagreb.

Desde os anos 1990, a universidade foi obtida uma grande autonomia, ao mesmo tempo, começou a adesão ao processo de Bolonha.