O jardim zoológico e o museu da natureza em Split surgiram graças doados a cidade no início do século XX, várias naturais valiosos coleções. O professor Humberto Джирометта em 1923, levantou a questão sobre a criação de um Museu de história natural. Conselho municipal de Split, tomou o assunto à consideração e em 1924 foi fundado o primeiro museu, e Джирометта tornou-se seu líder até sua morte, em 1939.

Nos primeiros anos de sua existência, o museu ficava localizado em um dos prédios municipais no coração do centro da cidade. Logo áreas tornou-se não perder, e o museu mudou-se para um dos edifícios do parque de Marjan. Juntamente com o museu foi inaugurado um pequeno jardim zoológico, que representou a algumas espécies nativas e exóticas de animais. Para a primeira, no território da ex-Jugoslávia Aquário ao lado do edifício do museu era ali extra sala. Alguns anos mais tarde, o Oceanário foi fechada e transformada num pequeno terrário. Hoje, o jardim zoológico em Split possui mais de 300 espécies de animais.

Edifício parque Marjan em tempo de guerra de 1991, foi fechada por motivos de segurança. Em seguida, o museu mudou-se para fortaleza Грипе, e depois de 1997 e voltou para Marjan. Após o ano de 2000, a pedido dos trabalhadores, as necessidades do Museu foi alocado um novo espaço, com uma área total de cerca de 1156 кв. m, em que o Museu começou a operar em janeiro de 2002.

Antes de abrir a nova diretora do museu foi realizada a reorganização do museu, переучтены coleção e adicionou várias novas exposições (por exemplo, uma coleção de animais empalhados e emplumados, o departamento de geologia e paleontologia, entomologia, departamento de vertebrados e invertebrados e т. д.). Também foram realizados trabalhos de tratamento e organização de exposições, pesquisa de campo no centro da Dalmácia, inúmeras exposições temáticas no museu e fora dele. Além disso, funcionários do Museu estão envolvidos em inúmeros congressos científicos.

No primeiro andar do museu, realizam-se várias exposições temáticas, e no rés-do-chão estão as exposições permanentes. Cada pessoa pode comprar no museu de mais conteúdo de museu de história local e história natural.