O novo edifício do convento de Santa Clara de Coimbra foi iniciado em 1649. O antigo mosteiro, construído no final do século XIII, foi destruída, e foi tomada a decisão de construir um novo prédio para o freiras da ordem de Santa Clara.

O projeto do mosteiro desenvolveu um monge beneditino e real, o arquiteto João Турриано, a construção conseguiu arquitecto real, Mateus doo Couto. A construção de um novo edifício durou o tempo suficiente. Em 1677, no novo edifício do mosteiro, que tornou-se conhecido como o mosteiro de Santa-Clara-a-Nova, entraram freiras. Em 1696, foi realizada a consagração do templo.

O portal da igreja da abadia de decora o brasão real, que é apoiado por dois anjos. O interior do templo é de estilo barroco. A igreja tem uma só nave, transepto falta. Laterais da capela e principal sistina decorar 14 запрестольных de imagens do século XVII, em estilo "талья dourada" - алтарные pintura na natureza esculpida e золоченого madeira. Além disso, no novo mosteiro passou túmulo com as cinzas da rainha santa Isabel Portuguesa, fundadora deste mosteiro. Após a morte de seu marido, o rei Диниша, a rainha estava em коимбрском mosteiro de Santa Clara até a morte e foi enterrada ali mesmo. Portanto, entre os habitantes locais, esta casa também é chamado mosteiro da rainha santa Isabel. O túmulo com as cinzas, feita a partir de prata e cristal, está perto do altar-mor da igreja. Antes de igreja é um monumento a rainha Isabel, executado pelo escultor Antonio Тексейра Lopes no século XIX.

Em 1733 no mosteiro foram construídas galerias cobertas em estilo renascentista. A construção dessas galerias conseguiu arquitecto húngaro Carlos Мардел.