A arquitetura da sinagoga Ben Ezra não é diferente de um padrão de arquitetura de igrejas coptas. Isso aconteceu porque o edifício e foi inicialmente igreja, mas no final de X в. califa Hakim fechou a igreja. Em tempos mais recentes este edifício comprou a comunidade judaica, que na altura era uma parte significativa do egípcio da sociedade. A sinagoga foi chamado pelo nome de um rabino de Jerusalém, de Abraham ben Ezra.

Famosa sinagoga fato de que, no século XIX, durante a reparação, aqui foi descoberto um tesouro com milhares de documentos XI-XII séculos.
Recentemente, a sinagoga отреставрировали.